狗狗真菌感染后会根据感染的严重程度以及感染部位等因素选择不同的抗真菌药。比如皮肤真菌感染多使用含有特比萘芬的抗真菌喷剂；耳道真菌感染多使用含有制霉菌素的乳膏等。皮肤真菌感染多由犬小孢子感染引起，临床表现以皮肤脱毛、瘙痒以及结痂为主，一些狗狗会出现比较特殊的“铜钱癣”。临床需要通过伍德氏灯和皮肤显微镜检查诊断。如果感染比较严重，还需要配合使用抗真菌香波和口服抗真菌的药物。耳道真菌感染多由马拉色菌感染引起，但耳道感染多为混合感染，比如合并细菌或耳螨感染。感染后的猫咪耳道分泌物会增加，同时猫咪会出现频繁甩头和挠耳廓的情况。临床需要通过检耳镜和耳道分泌物镜检诊断。治疗主要是先用洗耳水将可见的耳道分泌物清洗干净，然后使用抗真菌的耳药。