故事开始于"梦幻"。梦幻是一种传说中的宝可梦（也可称之为宠物小精灵）。非常强大的宝可梦，也是世界上最强的宝可梦。非常可爱的梦幻，若是只通过它的颜值来看，真是萌啊！
不过现实人类社会中，除了通过古老的图腾，石壁上雕琢的画像，能够看到梦幻的形象。活生生的梦幻，他们并没有看到过。以为只存在于传中之中。
在研究者们的探索中，他们幸运地找到了梦幻的一根睫毛。这根睫毛就很有神秘感了，微微的发出紫色的光芒。
利用这根眼睫毛，研究者们就复制出了梦幻，并且通过科技进一步提升复制体的能力，取了个全新的名字，称之为："超梦"。
超梦是梦幻的复制体（克隆），生来就有梦幻的一点点记忆。可是它作为独立的个体，具有独立的思想，与梦幻并不相通，已经是一个全新的生命体了。
超梦并不是从小开始成长，一睁眼，就已经是一位酷小伙了，甚至它在影片中的中文声音，很man啊，有点太老成了吧。
一个有着独立思想的新生命体，他会问："我是谁？""我来自哪里？""为什么我会在这里？"就像所有的小宝宝们，都喜欢问："为什么？"
不过超梦的强大实力，已经一睁眼就成年般的身体，并没有让他成为可爱萌的小天使宝宝，而是成为了过早长大的中二青年。研究者们还没有和他说上两句话，超梦就大肆搞破坏，破坏力也是毁灭性的，太强大，也太可怕了。
研究者们心怀梦想：创造世界上最强的宝可梦。也逝世于成功创造最强宝可梦的时间。
超梦破坏了研究所以后，依然寻找自己存在于世界的真理：我存在的目的？（活着的意义）
它与被它超强力量吸引来的坏人合作。联手对付其他宝可梦训练家。并且每一回出手，都大获全胜。可以说，只要它动一动手指，什么事都能办成。只不过全是坏事。
超梦不满足于此，解除了与坏人的合作。也证明了跟坏人合作可不是好事，这个坏人，就是怀着奴役超梦的心思，与超梦合作的。根本就不公平。包括送给超梦的装甲设备，也是他按一下开关，就可以束缚超梦的枷锁。
也让坏人意外的事，超梦的实力太强大了，一瞬间就破坏了这个高科技装甲设备。根本就没有东西，可以束缚超梦。
超梦决定自己做宝可梦训练家。他做主人，也控制了一个人类，做为他的女仆。
女仆协助超梦找到了几位宝可梦训练家。其中就有小智一组人。
小智（少年男主角）依然是和皮卡丘（宠物主角），杰尼龟，妙蛙种子，喷火龙等等，还有人类朋友小霞（少女疑似女主角）和小刚（大叔）。
他们在草地上，秀了一把相亲相爱短剧，小智与皮卡丘合作还接受了一炮灰的挑战，大获全胜。
然后接到了女仆送给他们的邀请卡，邀请他们到城堡。
前往城堡的途中，宝可梦训练家们也受到了挑战，风暴席卷海上，使他们无法正常坐船前往城堡。所以，这些年轻的宝可梦训练家们，不顾劝阻，利用宝可梦的能力，纷纷展示才能，冒雨进入海中，前往城堡。
小智等人倒是碰到了一只小船，坐着小船驶往城堡。不过暴风雨下的大海，轻易地就打翻了小船。顿时，小船的驾驶人也现形，原来正是火箭队（宝可梦动画片中可爱又迷人的反派组织）。火箭队在这里只是一直打酱油的角色呢。
虽然掉入了海中，可是小智等人依然通过自己的努力，平安登上了城堡。也遇见了超梦的女仆。
小刚觉得女仆很眼熟。
女仆领他们来到华丽而神秘的客厅。在这里，他们见到了同样被邀请来的其他宝可梦训练家。寒暄过后，又见到了城堡的现主人-超梦。
见到了超梦，最让他们意外的，还是它居然是宝可梦。
宝可梦怎么能做宝可梦训练家呢？
宝可梦是被训练家训练的宝可梦啊，宝可梦做了宝可梦训练家，那不就是自己训练自己？那还需要宝可梦训练家吗？自己训练自己还需要训练家？好绕啊。就是这种疑问。
肯定不是主人和奴隶这种疑问。
因为这些宝可梦训练家可是很爱自己的宝可梦们的！
故事的核心就在于此了。看起来像是主人和自己的宠物逻辑，实际上是朋友的逻辑。
超梦打趴了一个不客气的宝可梦训练家。带着自己复制的其它宝可梦们，一起挑战这些宝可梦训练家。
同时，超梦的女仆也被超梦抛弃，这位女仆被小刚认出来，正是失踪的乔伊小姐，甜美可爱的护士。
战斗开始。
超梦：训练家。带来了复制体：水箭龟，喷火龙，妙蛙花。
小智：训练家。出了：喷火龙。
还有其他两位训练家出了：水箭龟和妙蛙花。
全都是复制体打趴本体。
哎呀，好揪心。怎么本体会打不过复制体呢？
超梦组获胜之后，释放出了很多的黑色精灵球。这些黑色精灵球也很厉害，可以轻易的捕获宝可梦们。就算是小智把宝可梦抢先收回红色普通精灵球里面，也不管用。黑色精灵球是连包含了宝可梦的红色精灵球，一起吸收了。
坚持到最后的皮卡丘，也终于被黑色精灵球捕获。它们被一起送入了地下宝可梦复制体制造中心。
在复制体制造中心，火箭们早就发现了这里的异常。连喵喵都被复制机器拔走了三根猫毛，复制出来了一只喵喵复制体。他们都是一脸懵逼啊。
其实跟着火箭队一起进来的还有可爱萌的梦幻。
梦幻的天真可爱，还有简单的快乐，真是让人向往。那种单纯的幸福感。
即使小智也跟了下来，想要保护皮卡丘，破坏了宝可梦复制机器。但是，宝可梦复制机器已经把这里的所有宝可梦都都给复制出来了一个新个体生命。
杰尼龟有复制体杰尼龟了。
妙蛙种子有复制体妙蛙种子了。
皮卡丘也有复制体皮卡丘了。
全都是如此，全都有了自己的复制体。除了人类们。貌似小智进入机器里面，并没有被复制啊，是不能复制人类吧。
这些宝可梦和复制体们，很快就进行了战斗。
超梦是为了让复制体们战胜那些本体宝可梦，让复制体们证明，复制体才是真的！
他们要证明自己！
不过本体和复制体打架，可真是惨烈啊。
比如皮卡丘打皮卡丘。
自己打自己？
只有喵喵和喵喵复制体，奇妙的没有打起来，而是一起赏月……是因为喵喵胆小不好战？还是因为喵喵会说人话？智商高？
梦幻这时候也出现了，出现的时候还救了小智一把。梦幻依然是可爱萌梦幻啊。
不过梦幻很快也跟超梦打起来了。梦幻打起来也很厉害。果然是世界上最强的宝可梦啊。打自己的复制体，依然很强。
所以，所有的本体和复制体打架，好像也没有高下之分，所以一直打，一直打，打不出胜负一样的感觉。
小智看不下去了，尤其皮卡丘根本就不愿意与复制体打架，所以皮卡丘几乎就是单方面挨揍。而且看复制体打不动了，皮卡丘还要过去扶着复制体打自己。
小智要阻止这场没有意义的战斗，他用自己的生命阻止了这场战斗。
所有的宝可梦，包括复制体宝可梦们，都感动的哭了。他们好像明白了什么。
所有的眼泪汇聚在小智的身上，神奇的一幕发生了。原本已经被梦幻和超梦的强力攻击，达成了黑乎乎一块人形石头的小智，居然恢复了生命。
小智重生了。
感人的音乐响起，感人的一幕被梦幻的光芒铺满，就像照亮了所有人的心灵，也包括屏幕前观影的我。
超梦也明白了，这场战斗并没有意义，而且，他也解开了心结。人类和宝可梦存在着深厚的友谊。并且，他们作为复制体，并没有被本体们轻视。宝可梦和人类是和平相处的。
但是，超梦并没有留在这里，他带着所有宝可梦复制体们，去寻找属于他们的领地，在新的世界里面生活。
超梦和梦幻一起发动技能，让在场的人类和宝可梦们都遗忘了一段记忆。
梦幻也依然是传说中的梦幻。没有人记得自己见到过他。
小智等人，在海边的出发地疑惑：我们为什么在这里？要去干什么？
不过他们并没有想很久，既来之则安之。非常的乐天本性。
海面上的暴风雨停止了，乌云间露出来美丽的微光，就像是希望。
美丽的场景，迷人的天地。
剧终啦。
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